Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLCO1B3Q9NPD5 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms