Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms