Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 AL352977.1-201ENST00000553464 453 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 AC245519.2-201ENST00000633673 475 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 WFDC13-201ENST00000305479 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 AC013439.1-201ENST00000449965 1239 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 CDH13-207ENST00000565636 810 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 AC008040.1-204ENST00000469301 1738 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 LYRM4-207ENST00000480566 941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 AC073167.1-201ENST00000559303 580 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 SPATA22-201ENST00000268981 1280 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 PGM5P4-AS1-204ENST00000450636 537 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 SAA2-203ENST00000526900 687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 LINC00852-201ENST00000475197 1328 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms