Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CEP44Q9C0F1 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms