Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CIPCQ9C0C6 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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