Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTNAP4Q9C0A0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms