Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
TRIM5Q9C035 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM5Q9C035 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms