Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VN1R3Q9BXE9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms