Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFT27Q9BW83 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFT27Q9BW83 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFT27Q9BW83 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFT27Q9BW83 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFT27Q9BW83 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFT27Q9BW83 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFT27Q9BW83 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFT27Q9BW83 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
IFT27Q9BW83 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
IFT27Q9BW83 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFT27Q9BW83 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFT27Q9BW83 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
IFT27Q9BW83 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFT27Q9BW83 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFT27Q9BW83 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFT27Q9BW83 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFT27Q9BW83 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFT27Q9BW83 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFT27Q9BW83 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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