Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms