Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms