Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GINS3Q9BRX5 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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