Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC27.55■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC27.54■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC27.54■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC27.53■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC27.53■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC27.53■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC27.53■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC27.53■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC27.52■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC27.51■■■□□ 2
FYCO1Q9BQS8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms