Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PMCHL2Q9BQD1 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms