Protein–RNA interactions for Protein: Q99941

ATF6B, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6BQ99941 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms