Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMAD5Q99717 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms