Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MYCBPQ99417 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 285.2 ms