Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC85AQ96PX6 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms