Protein–RNA interactions for Protein: Q96P69

GPR78, G-protein coupled receptor 78, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR78Q96P69 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPR78Q96P69 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR78Q96P69 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms