Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW7

LRRC7, Leucine-rich repeat-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC7Q96NW7 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC7Q96NW7 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms