Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms