Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms