Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC136Q96JN2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms