Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
HIC2Q96JB3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms