Protein–RNA interactions for Protein: Q96IT1

ZNF496, Zinc finger protein 496, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF496Q96IT1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms