Protein–RNA interactions for Protein: Q96GR4

ZDHHC12, Probable palmitoyltransferase ZDHHC12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC12Q96GR4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZDHHC12Q96GR4 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms