Protein–RNA interactions for Protein: Q96DL1

NXPE2, NXPE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE2Q96DL1 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NXPE2Q96DL1 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NXPE2Q96DL1 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NXPE2Q96DL1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NXPE2Q96DL1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NXPE2Q96DL1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NXPE2Q96DL1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NXPE2Q96DL1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NXPE2Q96DL1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms