Protein–RNA interactions for Protein: Q93099

HGD, Homogentisate 1,2-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGDQ93099 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HGDQ93099 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HGDQ93099 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HGDQ93099 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HGDQ93099 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HGDQ93099 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HGDQ93099 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HGDQ93099 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HGDQ93099 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HGDQ93099 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HGDQ93099 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HGDQ93099 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HGDQ93099 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HGDQ93099 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HGDQ93099 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HGDQ93099 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HGDQ93099 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HGDQ93099 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HGDQ93099 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HGDQ93099 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HGDQ93099 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HGDQ93099 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HGDQ93099 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HGDQ93099 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HGDQ93099 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HGDQ93099 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HGDQ93099 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HGDQ93099 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HGDQ93099 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HGDQ93099 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HGDQ93099 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HGDQ93099 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HGDQ93099 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HGDQ93099 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HGDQ93099 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HGDQ93099 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HGDQ93099 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HGDQ93099 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HGDQ93099 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HGDQ93099 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HGDQ93099 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HGDQ93099 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HGDQ93099 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HGDQ93099 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HGDQ93099 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HGDQ93099 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HGDQ93099 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HGDQ93099 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HGDQ93099 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HGDQ93099 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HGDQ93099 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HGDQ93099 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HGDQ93099 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HGDQ93099 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HGDQ93099 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HGDQ93099 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HGDQ93099 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HGDQ93099 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HGDQ93099 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HGDQ93099 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HGDQ93099 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HGDQ93099 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HGDQ93099 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HGDQ93099 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HGDQ93099 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HGDQ93099 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HGDQ93099 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HGDQ93099 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HGDQ93099 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HGDQ93099 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HGDQ93099 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HGDQ93099 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HGDQ93099 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HGDQ93099 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HGDQ93099 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HGDQ93099 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HGDQ93099 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HGDQ93099 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HGDQ93099 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HGDQ93099 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HGDQ93099 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HGDQ93099 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HGDQ93099 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HGDQ93099 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HGDQ93099 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HGDQ93099 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HGDQ93099 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HGDQ93099 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HGDQ93099 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HGDQ93099 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HGDQ93099 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HGDQ93099 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HGDQ93099 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HGDQ93099 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HGDQ93099 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HGDQ93099 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HGDQ93099 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HGDQ93099 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HGDQ93099 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HGDQ93099 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms