Protein–RNA interactions for Protein: Q92922

SMARCC1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCC1Q92922 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMARCC1Q92922 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCC1Q92922 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms