Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms