Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVY7

UBLCP1, Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBLCP1Q8WVY7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBLCP1Q8WVY7 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms