Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C17orf47Q8NEP4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C17orf47Q8NEP4 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms