Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DNAAF3Q8N9W5 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms