Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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SMIM20Q8N5G0 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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