Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIBP1Q86W92 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms