Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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TRAPPC6BQ86SZ2 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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TRAPPC6BQ86SZ2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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TRAPPC6BQ86SZ2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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TRAPPC6BQ86SZ2 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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