Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHA9Q7RTU4 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms