Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms