Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED9Q6R2W3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
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