Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
KLHL35Q6PF15 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms