Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q6P435 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q6P435 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q6P435 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q6P435 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q6P435 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q6P435 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q6P435 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q6P435 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q6P435 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q6P435 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q6P435 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q6P435 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q6P435 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q6P435 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Q6P435 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q6P435 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q6P435 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q6P435 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q6P435 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q6P435 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q6P435 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q6P435 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q6P435 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q6P435 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Q6P435 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Q6P435 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Q6P435 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Q6P435 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Q6P435 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6P435 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6P435 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6P435 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6P435 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6P435 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6P435 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6P435 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6P435 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6P435 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6P435 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6P435 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6P435 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6P435 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6P435 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6P435 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6P435 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6P435 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6P435 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6P435 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6P435 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6P435 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6P435 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6P435 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6P435 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6P435 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6P435 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6P435 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6P435 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6P435 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6P435 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6P435 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6P435 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6P435 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6P435 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6P435 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6P435 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6P435 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6P435 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6P435 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q6P435 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q6P435 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q6P435 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q6P435 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q6P435 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q6P435 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q6P435 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q6P435 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q6P435 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q6P435 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q6P435 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q6P435 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q6P435 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q6P435 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Q6P435 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q6P435 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q6P435 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q6P435 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q6P435 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q6P435 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q6P435 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q6P435 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q6P435 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Q6P435 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q6P435 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Q6P435 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Q6P435 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q6P435 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q6P435 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q6P435 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q6P435 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms