Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RWDD4Q6NW29 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms