Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms