Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.1 ms