Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF20Q5VTR2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms