Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Q5VSD8 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Q5VSD8 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Q5VSD8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q5VSD8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q5VSD8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q5VSD8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q5VSD8 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q5VSD8 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q5VSD8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q5VSD8 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q5VSD8 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q5VSD8 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q5VSD8 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q5VSD8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q5VSD8 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q5VSD8 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q5VSD8 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q5VSD8 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q5VSD8 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q5VSD8 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q5VSD8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q5VSD8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q5VSD8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q5VSD8 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q5VSD8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q5VSD8 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q5VSD8 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q5VSD8 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q5VSD8 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q5VSD8 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q5VSD8 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q5VSD8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q5VSD8 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q5VSD8 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q5VSD8 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Q5VSD8 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Q5VSD8 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q5VSD8 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q5VSD8 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q5VSD8 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q5VSD8 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q5VSD8 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q5VSD8 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q5VSD8 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q5VSD8 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q5VSD8 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q5VSD8 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q5VSD8 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Q5VSD8 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q5VSD8 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q5VSD8 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q5VSD8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q5VSD8 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q5VSD8 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q5VSD8 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q5VSD8 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q5VSD8 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q5VSD8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q5VSD8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q5VSD8 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q5VSD8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q5VSD8 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q5VSD8 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Q5VSD8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Q5VSD8 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q5VSD8 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Q5VSD8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q5VSD8 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q5VSD8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q5VSD8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q5VSD8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q5VSD8 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q5VSD8 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q5VSD8 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q5VSD8 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q5VSD8 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q5VSD8 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q5VSD8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q5VSD8 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q5VSD8 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q5VSD8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q5VSD8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q5VSD8 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q5VSD8 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q5VSD8 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Q5VSD8 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q5VSD8 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Q5VSD8 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Q5VSD8 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q5VSD8 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Q5VSD8 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q5VSD8 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q5VSD8 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q5VSD8 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q5VSD8 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q5VSD8 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q5VSD8 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q5VSD8 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Q5VSD8 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms