Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FRMPD1Q5SYB0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms