Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRMS1LQ5PSV4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms