Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms