Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTC6

AMER1, APC membrane recruitment protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER1Q5JTC6 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AMER1Q5JTC6 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms